直线导轨要想得到很好的加工精度保持它的性能特点，防尘是非常关键的一个措施。对于这种精度要求极高的部件来说，任何的一点灰尘和杂质都是不好的，它会破坏整个直线运动系统，进而缩短使用寿命。并且用户在使用过程中，切勿自行拆卸滑块，以免异物进入滑块内部，从而影响到直线导轨精度并缩短使用寿命。
一、直线运动系统的专用密封垫片
直线导轨系统里面离不开密封件的使用，因为它有不少的缝隙比较容易让灰尘和杂质钻空子，所以要想让整个系统内部达到一个密封的状态就必须要用密封垫片将这些缝隙给堵上。但是对于密封垫片的使用是有一些讲究的，它不是普通的材料就可以，相反，用于制作直线导轨密封垫片的材料必须是专业的橡胶材料，然后制作成清洁环。
二、橡胶垫片
橡胶垫片最大的好处就在于它具有非常强的韧性，弹性系数非常高，虽然它的制作成本比普通的塑料垫片高了很多，但是它作为垫片使用的时候可以不留半点缝隙。为提高防尘能力，在各直线导轨系统中备有高耐磨损性的特殊合成橡胶制造的密封垫片，以及（层叠式接触刮板等）和清洁环等配件。
三、专用伸缩防尘罩
防尘罩的使用对防尘也有很好的效果，现在使用的防尘罩有专门针对恶劣环境和普通的工作环境两种。在恶劣环境下使用的防尘罩柔软性是非常好的，它可以自由的伸缩，这样就能应对不同的机床结构。还有一种是专业防尘器，它主要是防止灰尘接近直线导轨。
在使用环境恶劣的场所，有些型号备有专用软式伸缩防尘罩和专用防尘盖。另外，当需要在易于遭受切削屑和切削液喷溅影响的环境中使用时，建议使用软式圆形伸缩罩来保护整个系统，或使用大型伸缩防尘罩。